Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRIM10Q9UDY6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM10Q9UDY6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms