Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GDE1Q9NZC3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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