Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDK12Q9NYV4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDK12Q9NYV4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms