Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GJB4Q9NTQ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJB4Q9NTQ9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms