Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC4BQ9NT99 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC4BQ9NT99 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms