Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC6A13Q9NSD5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC6A13Q9NSD5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms