Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SERINC1Q9NRX5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms