Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 216
UTP3Q9NQZ2 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 216
UTP3Q9NQZ2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 216
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-208ENST00000537553 6543 ntTSL 28.14□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-204ENST00000433722 3012 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-216ENST00000548676 3221 ntTSL 1 (best)7.16□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.362e-6■■■■■ 215.9
UTP3Q9NQZ2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 EML3-203ENST00000394776 2818 ntTSL 220.16■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.693e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 EML3-213ENST00000494448 3665 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-206ENST00000430655 2157 ntTSL 1 (best)25.95■■□□□ 1.748e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.568e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-205ENST00000424847 1563 ntTSL 1 (best)24.71■■□□□ 1.558e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.358e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-207ENST00000433912 1063 ntTSL 221.39■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.668e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.588e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 SLC25A36-212ENST00000513887 578 ntTSL 315.39■□□□□ 0.053e-12■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 213.25□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 ABCB6-213ENST00000497882 3008 ntTSL 212.54□□□□□ -0.48e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.838e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 AC091987.1-202ENST00000522464 789 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 215.8
UTP3Q9NQZ2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.645e-7■■■■■ 215.7
UTP3Q9NQZ2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 215.7
UTP3Q9NQZ2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 215.7
UTP3Q9NQZ2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.189e-7■■■■■ 215.6
UTP3Q9NQZ2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 215.6
UTP3Q9NQZ2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 215.5
UTP3Q9NQZ2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-8■■■■■ 215.5
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.921e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-204ENST00000565890 2368 ntTSL 225.85■■□□□ 1.731e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-205ENST00000566204 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 416.8■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-207ENST00000567827 470 ntTSL 315.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-202ENST00000457689 1297 ntTSL 214.44□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-203ENST00000564238 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 SPATA33-201ENST00000301031 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 IQSEC1-205ENST00000618604 3744 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 215.4
UTP3Q9NQZ2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.61e-20■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN6-207ENST00000491382 989 ntTSL 217.06■□□□□ 0.321e-20■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-20■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-20■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-20■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 SLC20A1-204ENST00000433924 638 ntTSL 413.34□□□□□ -0.273e-43■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-20■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 SLC20A1-209ENST00000498224 692 ntTSL 211.31□□□□□ -0.63e-43■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 SLC20A1-203ENST00000423633 668 ntTSL 29.04□□□□□ -0.963e-43■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 SLC20A1-205ENST00000456264 574 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-43■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 SLC20A1-202ENST00000413135 584 ntTSL 57.44□□□□□ -1.223e-43■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 AL512590.3-203ENST00000532526 5330 ntTSL 212.41□□□□□ -0.427e-8■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 AL512590.3-202ENST00000534123 6463 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 AL512590.3-201ENST00000375206 6269 ntTSL 210.41□□□□□ -0.747e-8■■■■■ 215.3
UTP3Q9NQZ2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 215.2
UTP3Q9NQZ2 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 215.2
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-216ENST00000583048 588 ntTSL 413.9□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 215.2
UTP3Q9NQZ2 XYLT2-202ENST00000376550 3267 ntTSL 1 (best)13.47□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 215.2
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-206ENST00000544801 875 ntTSL 517.33■□□□□ 0.369e-10■■■■■ 215
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-207ENST00000544880 591 ntTSL 416.58■□□□□ 0.249e-10■■■■■ 215
UTP3Q9NQZ2 AP003108.2-205ENST00000538594 569 ntTSL 49.06□□□□□ -0.969e-10■■■■■ 215
UTP3Q9NQZ2 TMEM241-214ENST00000581444 1404 ntTSL 220.87■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 215
UTP3Q9NQZ2 PELI1-202ENST00000466177 698 ntTSL 521.98■■□□□ 1.111e-7■■■■■ 214.9
UTP3Q9NQZ2 PELI1-201ENST00000358912 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 214.9
UTP3Q9NQZ2 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 214.8
UTP3Q9NQZ2 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 214.8
UTP3Q9NQZ2 RHBDD1-214ENST00000493526 1003 ntTSL 39.36□□□□□ -0.919e-7■■■■■ 214.8
UTP3Q9NQZ2 RHBDD1-213ENST00000491490 801 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 214.8
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.917e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.837e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.227e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-213ENST00000491893 4186 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 DAPK1-212ENST00000489291 4334 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 214.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF10-210ENST00000522435 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 DHCR7-206ENST00000527316 1005 ntTSL 522.92■■□□□ 1.261e-10■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 319.3■□□□□ 0.681e-7■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.371e-8■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.251e-10■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 DHCR7-211ENST00000534701 456 ntTSL 312□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 LATS1-203ENST00000441107 3879 ntTSL 1 (best)3.54□□□□□ -1.841e-8■■■■■ 214.3
UTP3Q9NQZ2 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 214.2
UTP3Q9NQZ2 PVT1-211ENST00000521600 408 ntTSL 24.96□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 214.2
UTP3Q9NQZ2 PVT1-202ENST00000512617 383 ntTSL 34.16□□□□□ -1.742e-7■■■■■ 214.2
UTP3Q9NQZ2 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 213.8
UTP3Q9NQZ2 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 213.8
UTP3Q9NQZ2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.611e-6■■■■■ 213.7
UTP3Q9NQZ2 PAK4-207ENST00000597766 380 ntTSL 319.61■□□□□ 0.733e-9■■■■■ 213.6
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 954.5 ms