Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPHNQ9NQX3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms