Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ94

A1CF, APOBEC1 complementation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1CFQ9NQ94 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A1CFQ9NQ94 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A1CFQ9NQ94 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms