Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4GALTQ9NPC4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A4GALTQ9NPC4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms