Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HMG20AQ9NP66 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HMG20AQ9NP66 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms