Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARFGAP3Q9NP61 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms