Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVK-5Q9HDB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms