Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD1Q9GZZ0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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