Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDGFDQ9GZP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDGFDQ9GZP0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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