Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
POLR2J2Q9GZM3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
POLR2J2Q9GZM3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms