Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCSER1Q9C0I3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCSER1Q9C0I3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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