Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PUS3Q9BZE2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUS3Q9BZE2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms