Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PCGF6Q9BYE7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PCGF6Q9BYE7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms