Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDCA4Q9BXL8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms