Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms