Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
C9orf16Q9BUW7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf16Q9BUW7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms