Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAGR1Q9BTK6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAGR1Q9BTK6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms