Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
COPS4Q9BT78 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms