Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SDF4Q9BRK5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms