Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF559Q9BR84 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF559Q9BR84 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms