Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGME1Q9BQP7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms