Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGIP1Q9BQI5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGIP1Q9BQI5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms