Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SPOCK3Q9BQ16 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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