Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRBNQ96SW2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRBNQ96SW2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms