Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMG1Q96Q15 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMG1Q96Q15 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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