Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC9Q96Q05 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms