Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC7Q96M83 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC7Q96M83 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms