Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC114Q96M63 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC114Q96M63 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms