Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNX27Q96L92 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms