Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AC068205.1-201ENST00000526615 689 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A3Q96HJ5 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms