Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CALML4Q96GE6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms