Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC97Q96F63 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC97Q96F63 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms