Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RNFT2Q96EX2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms