Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEURL3Q96EH8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NEURL3Q96EH8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms