Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMD3Q96D46 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms