Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAF2Q96CS3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms