Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TRIM63Q969Q1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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TRIM63Q969Q1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM63Q969Q1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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