Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX38Q92620 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms