Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HELBQ8NG08 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms