Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDX2

SLC17A8, Vesicular glutamate transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A8Q8NDX2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC17A8Q8NDX2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC17A8Q8NDX2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms