Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PNLDC1Q8NA58 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNLDC1Q8NA58 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms