Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DTX3Q8N9I9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DTX3Q8N9I9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms