Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7U9

LINC00469, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00469, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00469Q8N7U9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00469Q8N7U9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00469Q8N7U9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms